No se si tu pregunta esta dirigida a la aplicación para la industria. En principio la ventaja se da cuando tengo agua salina a partir de un valor de TDS, ya que el costo operativo para un rango determinado es casi constante. En cambio si utilizas Intercambio iónico el costo operativo se incrementa con la salinidad debido al mayor consumo de regenerantes.
Esa es la principal diferencia a la hora de la comparación tambien hay que ver la ambiental.
Otra es la calidad constante del producto en la osmosis inversa, cosa que en el intercambio iónico se agota el lecho y en el caso de la sílice no detecta la misma.
Busca informacion en paginas web como la de GEbetz por ejemplo, donde hay infromacion básica al respecto.

Suerte.

Desventajas realmente no tiene, y ventajas que puedes tener agua pura evitando riesgos al consumir agua de grifo bastante contaminada con cal y cloro....