Hola Iván,

Cuando acotas, incluso aunque las líneas de referencia no lleguen a juntarse con las líneas que definen el objeto que estás acotando, estás marcando unos puntos de referencia no visibles.
Si cuando modificas las líneas que componen esos objetos incluyes esos puntos en la ventana de selección la cota, por su característica de asociatividad, se adaptará a las nuevas medidas del objeto.

Eso es algo que normalmente resulta conveniente, ya que no tiene mucho sentido modificar el tamaño o posición de un objeto y mantener su acotación como estaba.

Si nos das más detalles de qué es exactamente lo que te ocurre y qué es lo que has hecho justo antes de que te ocurra, seguro que te podremos explicar qué es lo que no estés haciendo bien.

Un saludo

Curro